Os personagens principais obtêm arcos altamente detalhados nos 38 volumes do mangá, e o anime não tem espaço suficiente para tudo isso.
O arco de Guts é longo, complexo e sombriamente atraente, e a série de anime apenas retratou partes dele.
O anime Tokyo Ghoul é conhecido por omitir ou reorganizar muitas cenas, o que prejudicou o arco do personagem de Ken Kaneki.
Narumi foi maravilhosa no anime, mas ela é ainda melhor no mangá Wotakoi , que tem 11 volumes.
O anime foi criticado por sua baixa taxa de quadros e animação mínima, o que realmente não deu vida ao personagem Tatsu.
O anime parou no meio da história do mangá, então o arco do personagem de Misaki Ayuzawa ficou inacabado.
O anime cortou o segundo arco da história, então o antagonista Near não teve a chance de mostrar aos espectadores o que ele pode fazer.